Üniversitesi’ne öğretim görevlisi olarak 2003 yılında katıldı ve 2006 yılında, Harvard Tıp Fakültesi’nde Doğum, Jinekoloji ve Üreme Biyolojisi alanlarında ve Harvard School of Public Health’de Epidemioloji alanında Yardımcı Doçentliğe; 2012 yılında ise Doçentliğe terfi etti. 2016 yılında, Dr. Missmer, Michigan Eyalet Üniversitesi’nin Küresel Etki Girişimi ile yetkilendirilmiş ilk Öğretim Üyesiydi ve şu anda College of Human Medicine’de Doğum, Jinekoloji ve Üreme Biyolojisi Departmanı’nda Profesördür. Ayrıca, Boston Çocuk Hastanesi Gençler ve Genç Yetişkinler Tıp Bölümü’nde yardımcı bilim insanı, Harvard Tıp Fakültesi’nde Pediatri’de Öğretim Görevlisi, Harvard T.H. Chan School of Public Health’de Epidemioloji Bölümü’nde Yardımcı Profesördür.
Stacey Missmer, 1998 yılında, Harvard Üniversitesi Nurses’ Health Study (NHS) araştırma grubuna katıldı. Dr. Missmer, 2012 yılında, Endometriozis için Boston Merkezi’ni kurdu ve liderlik ettiği kadın sağlığı araştırması olan ergenlikten yetişkinliğe çalışmasında direktör olarak görev yapmaktadır. Dr. Missmer halen Endometriozis özel ilgi grubu’nun başkan yardımcısı ve ayrıca Amerikan Üreme Hekimliği Derneği, beslenme özel ilgi grubu’nun geçen dönem başkanıdır. İnsan üreme istatistik danışma kurulu üyesidir ve şu anda NIH üreme sağlığı ağında veri güvenliği ve izleme kurulunda görev yapmaktadır. 200’ün üzerinde yüksek etkili bilimsel yayın, inceleme ve kitap bölümlerinin yazarı olan Dr. Missmer’in araştırması, üreme sağlığına ilişkin değiştirilebilir faktörlerin nedenleri, sonuçları ve keşfi üzerine odaklanmıştır.